Hlavný rozdiel spočíva vo funkčnosti a inštalácii. Prenosné platobné terminály sú vďaka svojej kompaktnosti schopné prijímať platby kartou bez nutnosti pevného pripojenia k pokladnici alebo dodatočného hardvéru. Naproti tomu stolové platobné terminály sú umiestnené na pevnom mieste predaja, čo zaručuje stabilnú a bezpečnú možnosť spracovania transakcií.
Zatiaľ čo prenosné platobné terminály ponúkajú flexibilitu, mobilitu a cenovo dostupnú možnosť, náklady na stolové platobné terminály môžu zahŕňať dodatočné výdavky na inštaláciu a údržbu.
Oba typy terminálov sú vybavené na prijímanie debetných kariet, čo podnikateľom poskytuje všestranné možnosti na uspokojenie rôznych preferencií zákazníkov a potrieb pri transakciách.